目前最常见的替代EB的核酸染料SYBR Green I（属于花氰类染料）虽然毒性比EB低、灵敏度比EB高，但由于其化学稳定性差（怕光、怕水、怕热），实验结果的重复性往往不尽人意；此外，SYBR Green I在电泳过程中能在DNA分子间移位，很容易使DNA条带模糊和扭曲，电泳清晰度和分辨率也不如EB。所以在实际应用中依然不能有效替代EB。