带正电荷的碱性染料苏木素与细胞中带负电荷的酸性物质结合使细胞核染成蓝色。苏木素(Haematorlin)是一种天然染料，是组胚、病理、泌尿、妇产科及各实验室中最常用的染色剂，主要用于细胞核染色。
PanEra研制开发的苏木素染色液（Hematoxylin Stain）综合了多种经典的苏木素染色方法，简化了很多步骤，缩短了操作时间，并且染色液内不使用汞、甲醇、二甲苯等有毒物质。既可以用于组织切片又可用于培养细胞的染色。